财政金融部作为管委会内设副处级机构，主要负责财政事务、国资管理及金融监管等工作。部门分设6个科室：预算科(负责收支预算编制和执行、国库管理、税务协调、政府采购、工资统发及办公室等职能)、综合科(负责行财社保等资金管理、非税管理、财政信息化建设等职能，同时承担机关支部工作)、建设科(负责镇办财政管理、工程建设及农口资金管理等职能)、国库集中支付核算科(负责会计核算、集中支付、财政监督、会计管理等职能)、国资金融科(负责国有资产和行政单位资产管理及金融事务监管等职能)和财政投资评审中心(负责财政性投资项目评审及政府投融资项目控制等职能)。